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研究データをSSBDで公開しました

理化学研究所が運営するバイオイメージングデータベース SSBD:database で,当研究室が関わる2件の研究データを公開しています.このたび,それぞれのデータセットにDOI(Digital Object Identifier)が付与され,研究データそのものを恒久的に参照・引用できるようになりました.


Time-lapse images of intracellular structure in elongating Arabidopsis zygotes
シロイヌナズナ受精卵の伸長から非対称分裂に至る過程で,アクチン繊維,微小管,ミトコンドリア,液胞膜などの細胞内構造をライブイメージングした画像データです.2023年にScientific Reportsで発表した東北大学・植田研究室との共同研究に関連するデータを公開しています.
SSBD:database|383-Hiromoto-PoralizeDiv
DOI: 10.24631/ssbd.db.2025.11.383
関連論文|Scientific Reports (2023)


Image datasets for training and evaluating virtual staining of plant cell structures and cell viability classification
明視野顕微鏡画像から深層学習によって植物細胞の構造を推定する「バーチャル染色」の学習・評価に用いた画像データです.タバコBY-2細胞を中心に,細胞膜,核,液胞,葉緑体などの解析に用いたデータを公開しています.2025年にPlant Molecular Biologyで発表した研究に関連するデータです.
SSBD:database|465-Ichita-VirtualStainPlant
DOI: 10.24631/ssbd.db.2026.09.465
関連論文|Plant Molecular Biology (2025)

今後も,論文として研究成果を発表するだけでなく,研究データについても再利用可能な形で公開していきたいと考えています.