招待講演
- 「機械学習を援用した生物画像解析が拓く細胞生物学の新展開」檜垣 匠 日本生薬学会第71回年会 シンポジウム「先端技術を活用した天然物化学研究の新展開」（オーガナイザー：松田研一（北海道大学）、人羅勇気（熊本大学）） 2025年9月
- 「機械学習を援用した植物細胞骨格のイメージング解析」檜垣 匠 第7回植物インフォマティクス研究会年会（オーガナイザー：花田耕介（九州工業大学）） 2024年9月
- Quantitative evaluation of cytoskeleton organization using fluorescence microscopic image analysis. Takumi Higaki The 20th International Microscopy Congress (IMC20) September, 2023
- 「画像解析に基づく細胞の定量評価と認識」檜垣 匠 日本農薬学会第48回大会シンポジウム「生命科学の新技術に学び、活かす」（共催：農薬バイオサイエンス研究会）（オーガナイザー：太田広人（崇城大学）、伊藤晋作（東京農業大学）） 2023年3月
- Three-dimensional scanning approaches for quantitative plant phenotyping. Takumi Higaki 14th IROAST International symposium on “Plant development and biotic interaction” (Organized by Masahiko Furutani) December, 2022
- Four-dimensional digital archiving and quantitative evaluation of Arabidopsis architectures. Takumi Higaki International symposium on “Plant-Structure-Optimization” (Organized by Toru Fujiwara, Kiyohiko Igarashi, Misato Ohtani, Lacey Samuels, Shinichiro Sawa) November, 2022
- 「植物細胞生物学を起点とした画像の定量評価と機械学習」檜垣 匠 第30回日本バイオイメージング学会記念シンポジウム「バイオイメージングの今、そしてこれから」（オーガナイザー：鈴木 亮（帝京大学）） 2021年9月
- Three-dimensional reconstruction of Arabidopsis plant architecture. Takumi Higaki Special Satellite Event “Plant Structure Optimization” in the 7th International Conference of Plant Cell Wall Biology (Organized by Taku Demura (NAIST), Toru Fujiwara (The University of Tokyo)) June, 2021
- 「生物画像の定量・分類・認識」檜垣 匠 第67回日本生態学会大会シンポジウム「植物フェノタイピング：表現型データの定量化，モデル化とその自動化をもう一度考える」（オーガナイザー：野下 浩司（九州大学）） 2020年3月
- Three-dimensional imaging and morphometry of large vacuole regeneration in plant cultured cells. Takumi Higaki Workshop in the 42nd Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan “The vacuole/lysosome; Where does it come from, how is it maintained and what does it do in the cell?” (Organized by Yui Jin (Tokyo Institute of Technology), Yoko Kimura (Shizuoka University)) December, 2019
- 「電子顕微鏡画像解析による生物微細構造の検出と認識」檜垣 匠 公益社団法人日本顕微鏡学会第62回シンポジウム「AIを用いた顕微イメージングの将来～科学技術から物理化学，そして生命科学への貢献～」（実行委員長：秋元 義弘（杏林大学）） 2019年11月
- Plasma membrane delivery of H+-ATPse for stomatal response. Takumi Higaki Mechanisms of plant perception –from the endogenous to the exogenous– (Organized by Hardtke Christian (UNIL) September, 2019
- Bioimage clustering and classification. Takumi Higaki KAIST-KU Joint Symposium 2018 (Organized by Gou Young Koh (KAIST), Pilhan Kim (KAIST)) October, 2018
- Quantification and classification of bioimages. Takumi Higaki The 2nd IROAST&IRCMS Joint Seminar－The 33rd IROAST Seminar (Organized by Jun Ohtani, Hitoshi Takizawa) August, 2018
- 「葉表皮細胞のジグゾーパズル型形態形成」桧垣 匠 文部科学省委託事業AIMaP研究会「反応拡散系と実験の融合」 （オーガナイザー：栄伸一郎（北海道大学）、長山雅晴（北海道大学）） 2018年2月
- 「画像解析による細胞骨格束化の定量評価」桧垣 匠 先端バイオイメージング支援プラットフォーム 画像解析支援 公開セミナー （オーガナイザー：上野 直人（基礎生物学研究所）） 2018年1月
- Mathematical modeling approaches to jigsaw-puzzle pattern formation by plant cells. Takumi Higaki The 1st IROAST Symposium “Plant Cell and Developmental Biology: Approaches to Multiscale Biosystems” (Organized by Mitsuhiro Aida, Takumi Higaki, Takashi Ishida) November, 2017
- A strange link between leaves and skulls? A theoretical model of jigsaw-puzzle pattern formation by plant leaf cells. Takumi Higaki International Symposium on Imaging Frontier 2017 (Organized by Imaging Frontier Center (IFC), RIST, Tokyo University of Science) July, 2017
- 「細胞動態を理解するための画像解析とモデル解析」桧垣 匠 日本植物学会第80回大会シンポジウム「多様な植物現象を理解するためのイメージング 細胞内構造から環境応答まで 」 （オーガナイザー：金岡 雅浩（名古屋大学）、植田 美那子（名古屋大学））2016年9月
- Quantitative cell biology of plant stomata. Takumi Higaki Multi-scale Plant Phenomics (Organized by Dr. Koji Noshita) Sep, 2016
- 「細胞生物学が数値解析に見る夢」桧垣 匠 京都大学数理解析研究所研究集会 「現象解明に向けた数値解析学の新展開」（オーガナイザー：齊藤 宣一（東京大学））2015年11月
- 「画像解析による生物微細構造の認識」桧垣 匠 第6回 植物電子顕微鏡若手ワークショップ （オーガナイザー：豊岡 公徳（理化学研究所））2015年9月
- 「電顕画像における注目構造の自動検索法の開発」桧垣 匠、朽名 夏麿、馳澤 盛一郎 日本植物学会第77回大会・認定NPO法人綜合画像研究支援主催シンポジウム「新世代の画像情報が切り開く世界」 （オーガナイザー：鮫島 正純（認定NPO法人綜合画像研究支援）、大隅 正子（認定NPO法人綜合画像研究支援、日本女子大学））2013年9月
- 「細胞壁と頭蓋骨:パターン形成ダイナミクスの数理モデルによる統合的理解」三浦 岳、桧垣 匠 第46回日本発生生物学会年会 サテライトシンポジウム「植物の逆襲」（オーガナイザー：藤本 仰一（大阪大学）、三浦 岳（九州大学））2013年5月
- 「生物医学分野における画像クラスタリング解析の実際」桧垣 匠 バイオインフォマティクスとモデルに関するシンポジウム（オーガナイザー：澤 進一郎（熊本大学））2013年1月
- 「ImageJを用いた画像解析入門」朽名 夏麿、桧垣 匠 第167回農林交流センターワークショップ「植物科学・作物育種におけるフェノーム解析 ～だれでも使える画像解析入門から先端技術まで～」（オーガナイザー：土生芳樹（農業生物資源研究所））2012年11月
- 「気孔のイメージング解析」 桧垣 匠 新学術領域研究「植物高CO2応答」勉強会「気孔応答」 （オーガナイザー：射場 厚（九州大学））2012年10月
- 「可視化と数値実験による細胞外インテリジェント系の機能解析」 桧垣 匠、秋田 佳恵、朽名 夏麿、馳澤 盛一郎 日本植物学会第76回大会シンポジウム「植物の細胞外インテリジェントシステム」 （オーガナイザー：西谷 和彦（東北大学））2012年9月
- 「超短パルスレーザー加工による気孔開閉メカニズムの研究」桧垣 匠 第１回グリーンフォトニクスセミナー 超短パルスレーザー細胞プロセス研究会 （オーガナイザー：細川 陽一郎（奈良先端科学技術大学院大学））2012年4月
- 「孔辺細胞における細胞骨格動態の定量的イメージング解析」桧垣 匠、朽名 夏麿、佐野 俊夫、近藤 矩朗、馳澤 盛一郎 日本植物学会第72回大会シンポジウム「気孔の生物学」 （オーガナイザー：島崎 研一郎（九州大学））2008年9月